La contaminacion de la cieanga de Ayapel, muchos son los factores que producen la contaminacion de la cienaga entre estos tenemos:
- La contaminacion de las basuras que son arrojadas inescrupulosamente por personas que saben el daño que producen.
-Contaminacion de aguas residuales o aguas negras que salen de alcantarillado
-La contaminacion del mercurio o azogue, este se da a traves del trabajo en la mineria. El azogue es arrastrado por la corriente y llega hasta la cienaga, contaminando el agua y los peces.
